Preview

Актуальная биотехнология

Расширенный поиск

ПОЛНОГЕНОМНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ И БИОИНФОРМАТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ИЗОЛЯТОВ PASTEURELLA MULTOCIDA

https://doi.org/10.20914/2304-4691-2020-3-548

Об авторах

А. О. Амиргазин
Национальный центр биотехнологии
Россия


К. К. Муканов
Национальный центр биотехнологии
Россия


М. А. Куйбагаров
Национальный центр биотехнологии
Россия


Т. Б. Карибаев
Национальный центр биотехнологии
Россия


Е. М. Раманкулов
Национальный центр биотехнологии
Россия


А. Б. Шевцов
Национальный центр биотехнологии
Россия


Список литературы

1. Souvorov A., Agarwala R., Lipman D.J.SKESA: strategic k-merextension for scrupulous assemblies //Genome biology. - 2018. - Т. 19. - №. 1. - С. 153.

2. Townsend K.M. et al. Genetic organization of Pasteurella multocida cap loci and development of a multiplex capsular PCR typing system //Journal of Clinical Microbiology. - 2001. - Т. 39. - №. 3. - С. 924-929.

3. Harper M. et al. Development of a rapid multiplex PCR assay to genotype Pasteurella multocida strains by use of the lipopolysaccharide outer core biosynthesis locus //Journal of Clinical Microbiology. - 2015. - Т. 53. - №. 2. - С. 477-485.

4. Pasteurella multocida multihost multilocus sequence type (MLST) database [Электронный ресурс].URL: http://pubmlst.org/pmultocida/multihost/introduction.shtml.

5. Brettin T. et al. RAST tk: a modular and extensible implementation of the RAST algorithm for building custom annotation pipelines and annotating batches of genomes //Scientific reports. - 2015. - Т. 5. - С. 8365.

6. Orynbayev M. et al. Biological characterization of Pasteurella multocida present in the Saiga population //BMC microbiology. - 2019. - Т. 19. - №. 1. - С. 37.


Рецензия

Для цитирования:


Амиргазин А.О., Муканов К.К., Куйбагаров М.А., Карибаев Т.Б., Раманкулов Е.М., Шевцов А.Б. ПОЛНОГЕНОМНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ И БИОИНФОРМАТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ИЗОЛЯТОВ PASTEURELLA MULTOCIDA. Актуальная биотехнология. 2020;(3):548. https://doi.org/10.20914/2304-4691-2020-3-548

Просмотров: 26


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2304-4691 (Print)