МЕТОДЫ БИОИНФОРМАТИЧЕСКОГО АНАЛИЗА ВИРУСНЫХ МЕТАГЕНОМОВ КИШЕЧНИКА ЧЕЛОВЕКА
https://doi.org/10.20914/2304-4691-2019-3-580
Об авторах
Е. В. СтариковаРоссия
К. М. Климина
Россия
А. А. Хурумова
Россия
Д. С. Ульянов
Россия
Е. Н. Ильина
Россия
Список литературы
1. Dutilh B.E. et al. A highly abundant bacteriophage discovered in the unknown sequences of human faecal metagenomes //Nature communications. 2014. Т. 5. С. 4498
2. Wood D.E., Salzberg S.L. Kraken: ultrafast metagenomic sequence classification using exact alignments //Genome biology. 2014. Т. 15. №. 3. С. R46.
3. Li D. et al. MEGAHIT: an ultra-fast single-node solution for large and complex metagenomics assembly via succinct de Bruijn graph // Bioinformatics. 2015. Т. 31. №. 10. С. 1674-1676.
4. Nurk S. et al. mеtаSРАdеs: a new versatile metagenomic assembler //Genome research. 2017. Т. 27. №. 5. С. 824-834.
5. Grazziotin A.L., Koonin E.V., Kristensen D.M. Prokaryotic virus orthologous groups (рVОGs): a resource for comparative genomics and protein family annotation //Nucleic acids research. 2016. С. gkw975.
Рецензия
Для цитирования:
Старикова Е.В., Климина К.М., Хурумова А.А., Ульянов Д.С., Ильина Е.Н. МЕТОДЫ БИОИНФОРМАТИЧЕСКОГО АНАЛИЗА ВИРУСНЫХ МЕТАГЕНОМОВ КИШЕЧНИКА ЧЕЛОВЕКА. Актуальная биотехнология. 2019;(3):580. https://doi.org/10.20914/2304-4691-2019-3-580